ประวัติความเป็นมา (History)
ภายใต้บริบทของการเปลี่ยนแปลงของประเทศไทย ที่มีผลกระทบจากต่างประเทศ เศรษฐกิจ สังคม และการเมือง ทำให้เกิดความจำเป็นที่จะต้องมีการพัฒนาระบบราชการอย่างจริงจังและต่อเนื่อง ได้มีการกำหนดวิสัยทัศน์ใหม่ของการพัฒนาระบบราชการ โดยยึดหลักการบริหารกิจการบ้านเมืองที่ดี แนวนโยบายการปฏิรูประบบราชการแนวใหม่ ทำให้เกิดการจัดตั้งศูนย์นวัตกรรมระบบขึ้นในปี พ.ศ. 2544
ศูนย์นวัตกรรมระบบมุ่งสร้างความเป็นเลิศในการบริหารจัดการระบบการทำงาน เพื่อรองรับกระแสการเปลี่ยนแปลงที่เป็นไปอย่างรวดเร็ว โดยนำยุทธศาสตร์ นโยบาย ทิศทางการพัฒนาต่างๆ ของประเทศ และประสบการณ์พัฒนาองค์กรอย่างต่อเนื่องมาประยุกต์ใช้กับระบบงาน พร้อมทั้งปรับแนวคิดของประชาคมในองค์กรให้พร้อมรับการเปลี่ยนแปลง เพื่อให้เกิดการพัฒนาองค์กรอย่างมีประสิทธิภาพประสิทธิผลสูงสุดต่อองค์กร